LentiCRISPRV2GFP

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  • Model: PVT10915
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LentiCRISPRV2GFP


Catalog No. PVT10915
Packing 2ug

 

LentiCRISPRV2GFP Information


Function Mammal Editing plasmids

Prokaryotic resistance: ampicillin Amp

Screening markers: bleomycin Zeo, green fluorescent GFP

Cloned strain: Escherichia coli Stbl3

Culture conditions: 37 degrees centigrade

 

LentiCRISPRV2GFP Description

PLentiCRISPRV2GFP is a plasmid expressing Cas9 and gRNA in mammalian cells.

LentiCRISPRV2-GFP

 

 

LentiCRISPRV2GFP Sequence

LOCUS       Exported               13131 bp ds-DNA     circular SYN 07-JUN-2018
DEFINITION  synthetic circular DNA
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    LentiCRISPRv2GFP
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 13131)
  AUTHORS   Triple Threat
  TITLE     Direct Submission
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..13131
                     /organism="synthetic DNA construct"
                     /mol_type="other DNA"
     promoter        1..241
                     /note="U6 promoter"
                     /note="RNA polymerase III promoter for human U6 snRNA"
     misc_RNA        266..341
                     /note="gRNA scaffold"
                     /note="guide RNA scaffold for the Streptococcus pyogenes 
                     CRISPR/Cas9 system"
     promoter        403..614
                     /note="EF-1-alpha core promoter"
                     /note="core promoter for human elongation factor 
                     EF-1-alpha"
     CDS             639..4742
                     /codon_start=1
                     /product="Cas9 (Csn1) endonuclease from the Streptococcus 
                     pyogenes Type II CRISPR/Cas system"
                     /note="Cas9"
                     /note="generates RNA-guided double strand breaks in DNA"
                     /translation="MDKKYSIGLDIGTNSVGWAVITDEYKVPSKKFKVLGNTDRHSIKK
                     NLIGALLFDSGETAEATRLKRTARRRYTRRKNRICYLQEIFSNEMAKVDDSFFHRLEES
                     FLVEEDKKHERHPIFGNIVDEVAYHEKYPTIYHLRKKLVDSTDKADLRLIYLALAHMIK
                     FRGHFLIEGDLNPDNSDVDKLFIQLVQTYNQLFEENPINASGVDAKAILSARLSKSRRL
                     ENLIAQLPGEKKNGLFGNLIALSLGLTPNFKSNFDLAEDAKLQLSKDTYDDDLDNLLAQ
                     IGDQYADLFLAAKNLSDAILLSDILRVNTEITKAPLSASMIKRYDEHHQDLTLLKALVR
                     QQLPEKYKEIFFDQSKNGYAGYIDGGASQEEFYKFIKPILEKMDGTEELLVKLNREDLL
                     RKQRTFDNGSIPHQIHLGELHAILRRQEDFYPFLKDNREKIEKILTFRIPYYVGPLARG
                     NSRFAWMTRKSEETITPWNFEEVVDKGASAQSFIERMTNFDKNLPNEKVLPKHSLLYEY
                     FTVYNELTKVKYVTEGMRKPAFLSGEQKKAIVDLLFKTNRKVTVKQLKEDYFKKIECFD
                     SVEISGVEDRFNASLGTYHDLLKIIKDKDFLDNEENEDILEDIVLTLTLFEDREMIEER
                     LKTYAHLFDDKVMKQLKRRRYTGWGRLSRKLINGIRDKQSGKTILDFLKSDGFANRNFM
                     QLIHDDSLTFKEDIQKAQVSGQGDSLHEHIANLAGSPAIKKGILQTVKVVDELVKVMGR
                     HKPENIVIEMARENQTTQKGQKNSRERMKRIEEGIKELGSQILKEHPVENTQLQNEKLY
                     LYYLQNGRDMYVDQELDINRLSDYDVDHIVPQSFLKDDSIDNKVLTRSDKNRGKSDNVP
                     SEEVVKKMKNYWRQLLNAKLITQRKFDNLTKAERGGLSELDKAGFIKRQLVETRQITKH
                     VAQILDSRMNTKYDENDKLIREVKVITLKSKLVSDFRKDFQFYKVREINNYHHAHDAYL
                     NAVVGTALIKKYPKLESEFVYGDYKVYDVRKMIAKSEQEIGKATAKYFFYSNIMNFFKT
                     EITLANGEIRKRPLIETNGETGEIVWDKGRDFATVRKVLSMPQVNIVKKTEVQTGGFSK
                     ESILPKRNSDKLIARKKDWDPKKYGGFDSPTVAYSVLVVAKVEKGKSKKLKSVKELLGI
                     TIMERSSFEKNPIDFLEAKGYKEVKKDLIIKLPKYSLFELENGRKRMLASAGELQKGNE
                     LALPSKYVNFLYLASHYEKLKGSPEDNEQKQLFVEQHKHYLDEIIEQISEFSKRVILAD
                     ANLDKVLSAYNKHRDKPIREQAENIIHLFTLTNLGAPAAFKYFDTTIDRKRYTSTKEVL
                     DATLIHQSITGLYETRIDLSQLGGD"
     CDS             4743..4790
                     /codon_start=1
                     /product="bipartite nuclear localization signal from 
                     nucleoplasmin"
                     /note="nucleoplasmin NLS"
                     /translation="KRPAATKKAGQAKKKK"
     CDS             4791..4814
                     /codon_start=1
                     /product="FLAG(R) epitope tag, followed by an enterokinase 
                     cleavage site"
                     /note="FLAG"
                     /translation="DYKDDDDK"
     CDS             4824..4880
                     /codon_start=1
                     /product="2A peptide from porcine teschovirus-1 
                     polyprotein"
                     /note="P2A"
                     /note="Eukaryotic ribosomes fail to insert a peptide bond 
                     between the Gly and Pro residues, yielding separate 
                     polypeptides."
                     /translation="ATNFSLLKQAGDVEENPGP"
     misc_feature    5616..6204
                     /note="WPRE"
                     /note="woodchuck hepatitis virus posttranscriptional 
                     regulatory element"
     LTR             6276..6509
                     /note="3' LTR (Delta-U3)"
                     /note="self-inactivating 3' long terminal repeat (LTR) from
                     HIV-1"
     polyA_signal    6541..6765
                     /note="bGH poly(A) signal"
                     /note="bovine growth hormone polyadenylation signal"
     rep_origin      6811..7239
                     /direction=RIGHT
                     /note="f1 ori"
                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow 
                     indicates direction of (+) strand synthesis"
     promoter        7253..7582
                     /note="SV40 promoter"
                     /note="SV40 enhancer and early promoter"
     rep_origin      7433..7568
                     /note="SV40 ori"
                     /note="SV40 origin of replication"
     promoter        7630..7677
                     /note="EM7 promoter"
                     /note="synthetic bacterial promoter "
     CDS             7696..8070
                     /codon_start=1
                     /gene="Sh ble from
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