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pJL- SaKKH- BE3

Model: PVT10482
Availability :  In Stock
  • pJL- SaKKH- BE3
$182.00
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pJL-SaKKH-BE3


PVT10482                2ug
 

pJL-SaKKH-BE3 Information

Prokaryotic resistance: ampicillin Amp

Clone strain: Escherichia coli Stbl3

Culture conditions: 37 C

 

pJL-SaKKH-BE3 Description

PJL-SaKKH-BE3 is a rat mammalian expression plasmid.

 

pJL-SaKKH-BE3 Sequence

LOCUS       Exported                7689 bp ds-DNA     circular SYN 01-DEC-2017
DEFINITION  synthetic circular DNA
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..7689
                     /organism="synthetic DNA construct"
                     /mol_type="other DNA"
     CDS             13..261
                     /codon_start=1
                     /product="uracil-DNA glycosylase inhibitor from a Bacillus 
                     subtilis bacteriophage (Mol et al., 1995)"
                     /label=UGI
                     /translation="TNLSDIIEKETGKQLVIQESILMLPEEVEEVIGNKPESDILVHTA
                     YDESTDENVMLLTSDAPEYKPWALVIQDSNGENKIKML"
     CDS             274..294
                     /codon_start=1
                     /product="nuclear localization signal of SV40 (simian virus
                     40) large T antigen"
                     /label=SV40 NLS
                     /translation="PKKKRKV"
     CDS             303..320
                     /codon_start=1
                     /product="6xHis affinity tag"
                     /label=6xHis
                     /translation="HHHHHH"
     polyA_signal    349..573
                     /label=bGH poly(A) signal
                     /note="bovine growth hormone polyadenylation signal"
     rep_origin      complement(1046..1634)
                     /direction=LEFT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
     CDS             complement(1805..2665)
                     /codon_start=1
                     /gene="bla"
                     /product="beta-lactamase"
                     /label=AmpR
                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                     related antibiotics"
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                     EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                     LIKHW"
     promoter        complement(2666..2770)
                     /gene="bla"
                     /label=AmpR promoter
     enhancer        3040..3419
                     /label=CMV enhancer
                     /note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
     promoter        3420..3623
                     /label=CMV promoter
                     /note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early 
                     promoter"
     promoter        3665..3683
                     /label=T7 promoter
                     /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase"
     CDS             3697..4383
                     /codon_start=1
                     /product="cytidine deaminase (C to U editing enzyme) from 
                     rat"
                     /label=APOBEC-1
                     /note="can use ssDNA as a substrate (Komor et al., 2016)"
                     /translation="MSSETGPVAVDPTLRRRIEPHEFEVFFDPRELRKETCLLYEINWG
                     GRHSIWRHTSQNTNKHVEVNFIEKFTTERYFCPNTRCSITWFLSWSPCGECSRAITEFL
                     SRYPHVTLFIYIARLYHHADPRNRQGLRDLISSGVTIQIMTEQESGYCWRNFVNYSPSN
                     EAHWPRYPHLWVRLYVLELYCIILGLPPCLNILRRKQPQLTFFTIALQSCHYQRLPPHI
                     LWATGLK"
     misc_feature    4432..7596
                     /label=SaKKHCas9n
     CDS             7597..7617
                     /codon_start=1
                     /product="nuclear localization signal of SV40 (simian virus
                     40) large T antigen"
                     /label=SV40 NLS
                     /translation="PKKKRKV"
     CDS             7624..7689
                     /codon_start=1
                     /product="three tandem FLAG(R) epitope tags, followed by an
                     enterokinase cleavage site"
                     /label=3xFLAG
                     /translation="DYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDK"
ORIGIN
        1 tctggtggtt ctactaatct gtcagatatt attgaaaagg agaccggtaa gcaactggtt
       61 atccaggaat ccatcctcat gctcccagag gaggtggaag aagtcattgg gaacaagccg
      121 gaaagcgata tactcgtgca caccgcctac gacgagagca ccgacgagaa tgtcatgctt
      181 ctgactagcg acgcccctga atacaagcct tgggctctgg tcatacagga tagcaacggt
      241 gagaacaaga ttaagatgct ctctggtggt tctcccaaga agaagaggaa agtctaaccg
      301 gtcatcatca ccatcaccat tgagtttaaa cccgctgatc agcctcgact gtgccttcta
      361 gttgccagcc atctgttgtt tgcccctccc ccgtgccttc cttgaccctg gaaggtgcca
      421 ctcccactgt cctttcctaa taaaatgagg aaattgcatc gcattgtctg agtaggtgtc
      481 attctattct ggggggtggg gtggggcagg acagcaaggg ggaggattgg gaagacaata
      541 gcaggcatgc tggggatgcg gtgggctcta tggcttctga ggcggaaaga accagctggg
      601 gctcgatacc gtcgacctct agctagagct tggcgtaatc atggtcatag ctgtttcctg
      661 tgtgaaattg ttatccgctc acaattccac acaacatacg agccggaagc ataaagtgta
      721 aagcctaggg tgcctaatga gtgagctaac tcacattaat tgcgttgcgc tcactgcccg
      781 ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg aatcggccaa cgcgcgggga
      841 gaggcggttt gcgtattggg cgctcttccg cttcctcgct cactgactcg ctgcgctcgg
      901 tcgttcggct gcggcgagcg gtatcagctc actcaaaggc ggtaatacgg ttatccacag
      961 aatcagggga taacgcagga aagaacatgt gagcaaaagg ccagcaaaag gccaggaacc
     1021 gtaaaaaggc cgcgttgctg gcgtttttcc ataggctccg cccccctgac gagcatcaca
     1081 aaaatcgacg ctcaagtcag aggtggcgaa acccgacagg actataaaga taccaggcgt
     1141 ttccccctgg aagctccctc gtgcgctctc ctgttccgac cctgccgctt accggatacc
     1201 tgtccgcctt tctcccttcg ggaagcgtgg cgctttctca tagctcacgc tgtaggtatc
     1261 tcagttcggt gtaggtcgtt cgctccaagc tgggctgtgt gcacgaaccc cccgttcagc
     1321 ccgaccgctg cgccttat