pLL3.7m- mTurquoise2- SLBP (18- 126)- IRES- H1- mMaroon1

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  • Model: PVT10347
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pLL3.7m-mTurquoise2-SLBP(18-126)-IRES-H1-mMaroon1


PVT10347    2ug

 

pLL3.7m-mTurquoise2-SLBP(18-126)-IRES-H1-mMaroon1 Sequence

LOCUS       Exported                9431 bp ds-DNA     circular SYN 27-SEP-2017
DEFINITION  synthetic circular DNA
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    .
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 9431)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Exported Sep 27, 2017  
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..9431
                     /organism="synthetic DNA construct"
                     /mol_type="other DNA"
     misc_feature    101..562
                     /label=IRES
                     /note="internal ribosome entry site (IRES) of the 
                     encephalomyocarditis virus (EMCV)"
     CDS             556..1902
                     /codon_start=1
                     /label=H1-mMaroon1
                     /translation="MIMATEFMTENSTSAPAAKPKRAKASKKSTDHPKYSDMIVAAIQA
                     EKNRAGSSRQSIQKYIKSHYKVGENADSQIKLSIKRLVTTGVLKQTKGVGASGSFRLAK
                     GDEPKRSVAFKKTKKEVKKVATPKKAAKPKKAASKAPSKKPKATPVKKAKKKPAATPKK
                     AKKPKVVKVKPVKASKPKKAKTVKPKAKSSAKRGSKKKSGLRSGGSGGMVSKGEELIKE
                     NMHTKLYLTGTVNNHYFECTAEGEGKPYEGTQTNRIKVVRGGPLPFAFDILAPCFMYGS
                     KTFINHPPDIPDYFKQSFPEGFTWERTTVYEDGGTLTATQDTSLQDGCLIYNVQVRGEN
                     FPSNGPVMQKKTLGWEASTETLYPADGSLEGRLDWALKLVGGGHLHCRLETTYRSKKPA
                     KNLKMPGVYFIDRRLERIKEADNETYVEQHEVAVARYCDLPSKLGHKLN"
     protein_bind    1930..1963
                     /label=loxP
                     /bound_moiety="Cre recombinase"
                     /note="Cre-mediated recombination occurs in the 8-bp core 
                     sequence (GCATACAT)."
     misc_feature    2019..2607
                     /label=WPRE
                     /note="woodchuck hepatitis virus posttranscriptional 
                     regulatory element"
     LTR             2849..3029
                     /label=5' LTR (truncated)
                     /note="truncated 5' long terminal repeat (LTR) from HIV-1"
     rep_origin      complement(3091..3679)
                     /direction=LEFT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
     CDS             complement(3850..4710)
                     /codon_start=1
                     /gene="bla"
                     /product="beta-lactamase"
                     /label=AmpR
                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                     related antibiotics"
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                     EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                     LIKHW"
     promoter        complement(4711..4815)
                     /gene="bla"
                     /label=AmpR promoter
     enhancer        4906..5209
                     /label=CMV enhancer
                     /note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
     promoter        5211..5409
                     /label=CMV promoter
                     /note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early 
                     promoter"
     LTR             5427..5607
                     /label=5' LTR (truncated)
                     /note="truncated 5' long terminal repeat (LTR) from HIV-1"
     misc_feature    5654..5779
                     /label=HIV-1 Psi
                     /note="packaging signal of human immunodeficiency virus 
                     type 1"
     misc_feature    6276..6509
                     /label=RRE
                     /note="The Rev response element (RRE) of HIV-1 allows for 
                     Rev-dependent mRNA export from the nucleus to the 
                     cytoplasm."
     misc_feature    7036..7153
                     /label=cPPT/CTS
                     /note="central polypurine tract and central termination 
                     sequence of HIV-1"
     protein_bind    7599..7632
                     /label=loxP
                     /bound_moiety="Cre recombinase"
                     /note="Cre-mediated recombination occurs in the 8-bp core 
                     sequence (GCATACAT)."
     enhancer        7748..8051
                     /label=CMV enhancer
                     /note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
     promoter        8052..8255
                     /label=CMV promoter
                     /note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early 
                     promoter"
     CDS             8291..9007
                     /codon_start=1
                     /product="enhanced monomeric variant of CFP (Goedhart et 
                     al., 2012)"
                     /label=mTurquoise2
                     /note="mammalian codon-optimized"
                     /translation="MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTL
                     KFICTTGKLPVPWPTLVTTLSWGVQCFARYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDD
                     GNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYFSDNVYITADKQKNGIK
                     ANFKIRHNIEDGGVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVL
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