pRK5- HA- Ubiquitin- K48

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  • Model: PVT10388
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pRK5-HA-Ubiquitin-K48

Catalog No. PVT10388
Packing 2ug

 

pRK5-HA-Ubiquitin-K48 Information
Function ORF expression plasmid
Resistance /
Screen /
Strain /
Culture temperature
Replicon
Copy
Promoter
Induction
Forward primer
Reverse primer

 

pRK5-HA-Ubiquitin-K48 Sequence

LOCUS       Exported                4996 bp ds-DNA     circular SYN 27-SEP-2017
DEFINITION  synthetic circular DNA
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    .
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 4996)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Exported Sep 27, 2017  
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..4996
                     /organism="synthetic DNA construct"
                     /mol_type="other DNA"
     enhancer        14..393
                     /label=CMV enhancer
                     /note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
     promoter        394..597
                     /label=CMV promoter
                     /note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early 
                     promoter"
     promoter        828..846
                     /label=SP6 promoter
                     /note="promoter for bacteriophage SP6 RNA polymerase"
     regulatory      963..972
                     /regulatory_class="other"
                     /note="vertebrate consensus sequence for strong initiation 
                     of translation (Kozak, 1987)"
     CDS             975..1001
                     /codon_start=1
                     /product="HA (human influenza hemagglutinin) epitope tag"
                     /label=HA
                     /translation="YPYDVPDYA"
     CDS             1032..1259
                     /codon_start=1
                     /product="human ubiquitin variant containing Lys-48, with 
                     all other lysines mutated to arginine"
                     /label=ubiquitin-K48
                     /translation="MQIFVRTLTGRTITLEVEPSDTIENVRARIQDREGIPPDQQRLIF
                     AGKQLEDGRTLSDYNIQRESTLHLVLRLRGG"
     regulatory      1296..1305
                     /regulatory_class="other"
                     /note="vertebrate consensus sequence for strong initiation 
                     of translation (Kozak, 1987)"
     polyA_signal    1309..1443
                     /label=SV40 poly(A) signal
                     /note="SV40 polyadenylation signal"
     promoter        1512..1869
                     /label=SV40 promoter
                     /note="SV40 enhancer and early promoter"
     rep_origin      1720..1855
                     /label=SV40 ori
                     /note="SV40 origin of replication"
     rep_origin      2118..2573
                     /direction=RIGHT
                     /label=f1 ori
                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow 
                     indicates direction of (+) strand synthesis"
     promoter        2855..2959
                     /gene="bla"
                     /label=AmpR promoter
     CDS             2960..3820
                     /codon_start=1
                     /gene="bla"
                     /product="beta-lactamase"
                     /label=AmpR
                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                     related antibiotics"
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                     EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                     LIKHW"
     rep_origin      3991..4579
                     /direction=RIGHT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
ORIGIN
        1 ttcgagctcg cccgacattg attattgact agttattaat agtaatcaat tacggggtca
       61 ttagttcata gcccatatat ggagttccgc gttacataac ttacggtaaa tggcccgcct
      121 ggctgaccgc ccaacgaccc ccgcccattg acgtcaataa tgacgtatgt tcccatagta
      181 acgccaatag ggactttcca ttgacgtcaa tgggtggagt atttacggta aactgcccac
      241 ttggcagtac atcaagtgta tcatatgcca agtacgcccc ctattgacgt caatgacggt
      301 aaatggcccg cctggcatta tgcccagtac atgaccttat gggactttcc tacttggcag
      361 tacatctacg tattagtcat cgctattacc atggtgatgc ggttttggca gtacatcaat
      421 gggcgtggat agcggtttga ctcacgggga tttccaagtc tccaccccat tgacgtcaat
      481 gggagtttgt tttggcacca aaatcaacgg gactttccaa aatgtcgtaa caactccgcc
      541 ccattgacgc aaatgggcgg taggcgtgta cggtgggagg tctatataag cagagctcgt
      601 ttagtgaacc gtcagatcgc ctggagacgc catccacgct gttttgacct ccatagaaga
      661 caccgggacc gatccagcct ccgcggccgg gaacggtgca ttggaacgcg gattccccgt
      721 gccaagagtg acgtaagtac cgcctataga gtctataggc ccaccccctt ggcttcgtta
      781 gaacgcggct acaattaata cataacctta tgtatcatac acatacgatt taggtgacac
      841 tatagaataa catccacttt gcctttctct ccacaggtgt ccactcccag gtccaactgc
      901 acctcggttc tatcgattga attcccgaac cgacagtcgg tctcttcacc aaggccattc
      961 gcgccaccat gggctacccc tatgatgtgc ctgactacgc agatctcaat ggtggtggtg
     1021 gtgggtcgac catgcagatc ttcgtcagaa cgttaaccgg tagaaccata actctagaag
     1081 ttgaaccatc cgataccatc gaaaacgtta gagctagaat tcaagacaga gaaggcattc
     1141 cacctgatca acaaagattg atctttgccg gtaagcagct cgaggacggt agaacgctgt
     1201 ctgattacaa cattcagaga gagtccaccc tgcacctggt cctccgtctc agaggtggtt
     1261 gagcggccgc taagtaagta aggatcccca gcttggccgc catggcccaa cttgtttatt
     1321 gcagcttata atggttacaa ataaagcaat agcatcacaa atttcacaaa taaagcattt
     1381 ttttcactgc attctagttg tggtttgtcc aaactcatca atgtatctta tcatgtctgg
     1441 atcgggaatt aattcggcgc agcaccatgg cctgaaataa cctctgaaag aggaacttgg
     1501 ttaggtacct tctgaggcgg aaagaaccag ctgtggaatg tgtgtcagtt agggtgtgga
     1561 aagtccccag gctccccagc aggcagaagt atgcaaagca tgcatctcaa ttagtcagca
     1621 accaggtgtg gaaagtcccc aggctcccca gcaggcagaa gtatgcaaag catgcatctc
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