pTE4254

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  • Model: PVT10992
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pTE4254


Catalog No. PVT10992
Packing 2ug

 

pTE4254 Information
Function Mammal Editing plasmids
Resistance Amp
Screen Neo/G418
Strain Stbl3
Culture temperature 37degrees centigrade
Replicon pUC
Copy high
Promoter U6

 

pTE4254 Description

PTE4254 is a plasmid expressing CAS9 and gRNA in mammalian cells.

 

pTE4254 Multiple cloning site

pTE4254-vector

 

 

pTE4254 Sequence

LOCUS       Exported                9204 bp ds-DNA     circular SYN 20-DEC-2017
DEFINITION  synthetic circular DNA
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..9204
                     /organism="synthetic DNA construct"
                     /mol_type="other DNA"
     enhancer        18..397
                     /label=CMV enhancer
                     /note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
     promoter        398..601
                     /label=CMV promoter
                     /note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early 
                     promoter"
     CDS             716..4078
                     /codon_start=1
                     /product="Cas9 (Csn1) endonuclease from the Streptococcus 
                     thermophilus Type II CRISPR/Cas system"
                     /label=St1Cas9
                     /note="generates RNA-guided double strand breaks in DNA"
                     /translation="MSDLVLGLDIGIGSVGVGILNKVTGEIIHKNSRIFPAAQAENNLV
                     RRTNRQGRRLARRKKHRRVRLNRLFEESGLITDFTKISINLNPYQLRVKGLTDELSNEE
                     LFIALKNMVKHRGISYLDDASDDGNSSVGDYAQIVKENSKQLETKTPGQIQLERYQTYG
                     QLRGDFTVEKDGKKHRLINVFPTSAYRSEALRILQTQQEFNPQITDEFINRYLEILTGK
                     RKYYHGPGNEKSRTDYGRYRTSGETLDNIFGILIGKCTFYPDEFRAAKASYTAQEFNLL
                     NDLNNLTVPTETKKLSKEQKNQIINYVKNEKAMGPAKLFKYIAKLLSCDVADIKGYRID
                     KSGKAEIHTFEAYRKMKTLETLDIEQMDRETLDKLAYVLTLNTEREGIQEALEHEFADG
                     SFSQKQVDELVQFRKANSSIFGKGWHNFSVKLMMELIPELYETSEEQMTILTRLGKQKT
                     TSSSNKTKYIDEKLLTEEIYNPVVAKSVRQAIKIVNAAIKEYGDFDNIVIEMARETNED
                     DEKKAIQKIQKANKDEKDAAMLKAANQYNGKAELPHSVFHGHKQLATKIRLWHQQGERC
                     LYTGKTISIHDLINNSNQFEVDHILPLSITFDDSLANKVLVYATANQEKGQRTPYQALD
                     SMDDAWSFRELKAFVRESKTLSNKKKEYLLTEEDISKFDVRKKFIERNLVDTLYASRVV
                     LNALQEHFRAHKIDTKVSVVRGQFTSQLRRHWGIEKTRDTYHHHAVDALIIAASSQLNL
                     WKKQKNTLVSYSEDQLLDIETGELISDDEYKESVFKAPYQHFVDTLKSKEFEDSILFSY
                     QVDSKFNRKISDATIYATRQAKVGKDKADETYVLGKIKDIYTQDGYDAFMKIYKKDKSK
                     FLMYRHDPQTFEKVIEPILENYPNKQINDKGKEVPCNPFLKYKEEHGYIRKYSKKGNGP
                     EIKSLKYYDSKLGNHIDITPKDSNNKVVLQSVSPWRADVYFNKTTGKYEILGLKYADLQ
                     FDKGTGTYKISQEKYNDIKKKEGVDSDSEFKFTLYKNDLLLVKDTETKEQQLFRFLSRT
                     MPKQKHYVELKPYDKQKFEGGEALIKVLGNVANSGQCKKGLGKSNISIYKVRTDVLGNQ
                     HIIKNEGDKPKLDF"
     CDS             4091..4111
                     /codon_start=1
                     /product="nuclear localization signal of SV40 (simian virus
                     40) large T antigen"
                     /label=SV40 NLS
                     /translation="PKKKRKV"
     polyA_signal    4211..4259
                     /label=HSV TK poly(A) signal
                     /note="herpes simplex virus thymidine kinase 
                     polyadenylation signal (Cole and Stacy, 1985)"
     rep_origin      4461..4889
                     /direction=RIGHT
                     /label=f1 ori
                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow 
                     indicates direction of (+) strand synthesis"
     promoter        4903..5232
                     /label=SV40 promoter
                     /note="SV40 enhancer and early promoter"
     rep_origin      5083..5218
                     /label=SV40 ori
                     /note="SV40 origin of replication"
     CDS             5299..6093
                     /codon_start=1
                     /gene="aph(3')-II (or nptII)"
                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"
                     /label=Neo
                     /note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418 
                     (Geneticin(R))"
                     /translation="MIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQGRP
                     VLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQDLLS
                     SHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPATCPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDEEHQ
                     GLAPAELFARLKARMPDGEDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQDIA
                     LATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"
     polyA_signal    6269..6390
                     /label=SV40 poly(A) signal
                     /note="SV40 polyadenylation signal"
     rep_origin      complement(6841..7429)
                     /direction=LEFT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
     CDS             complement(7600..8460)
                     /codon_start=1
                     /gene="bla"
                     /product="beta-lactamase"
                     /label=AmpR
                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                     related antibiotics"
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                     EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                     LIKHW"
     promoter        complement(8461..8565)
                     /gene="bla"
                     /label=AmpR promoter
     promoter        complement(8929..9169)
                     /label=U6 promoter
                     /note="RNA polymerase III promoter for human U6 snRNA"
ORIGIN
        1 atgctagttg gcgcgttgac attgattatt gactagttat taatagtaat caattacggg
       61 gtcattagtt catagcccat atatggagtt ccgcgttaca taacttacgg taaatggccc
      121
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